بر خلاف ناهنجاری های زیادی که از طریق سونوگرافی در دوارن بارداری قابل تشخیص است ،‌تعداد زیادی از ناهنجاری های جنینی وجود دارند که دوران بارداری قابل تشخیص نیستند ناهنجاری هایی مانند بیماری های پوستی مانند زالی یا تشخیص ضایعه های پوستی در دوران بارداری از طریق سونوگرافی قابل تشخیص نیست ، اوتیسم و موارد بهره هوشی یا ناشنوایی یا نابینایی عصبی جنین قابل تشخیص نیست.

پیلکتازی خفیف کلیه جنین یک یافته شایع و معمول در سونوگرافی دوران بارداری می باشد. اگر پیلکتازی با نتیجه منفی غربالگری های کروموزومی دوران بارداری بخصوص سل فری DNA